Sur leurs terres, les Toyota TS050 HYBRID ont bien failli monopoliser la 1ère ligne des 6 Heures de Fuji, mais c’était sans compter sur la concurrence qui n’a pas lâché le moindre millièmes. La pole de cette édition 2016 s’est jouée à 0.025s. L’Audi R18 de Loïc Duval et Lucas di Grassi s’est offert une deuxième pole cette saison (la 5ème pour Audi) après celle décrochée à Mexico. Avec un chrono de 1.23.570, le tandem de la #8  a devancé de 25 petits millièmes la Porsche 919 Hybrid de Mark Webber et Timo Bernhard. Les Toyota TS050 HYBRID s’élanceront toutes deux depuis la deuxième ligne. Sur la #5, Buemi/Nakajima ont concédé 0.169s et Sarrazin/Kobayashi 0.211s. L’Audi de Lotterer/Tréluyer et la Porsche de Jani/Lieb ont fait mieux que faire de la figuration, la #7 échouant à 0.286s et la #2 à 0.564s. Comme depuis le début du meeting, Rebellion Racing a devancé ByKolles Racing en LM P1 privé.

En LM P2, G-Drive Racing a placé l’ORECA 05 en pole pour la 5ème fois de la saison grâce à Stevens/Rusinov. L’Alpine A460/Signatech-Alpine de Menezes/Lapierre a décroché le 2ème temps devant la Ligier JS P2/Tequila Patron ESM de Gelael/Giovinazzi et la Ligier JS P2/RGR Sport by Morand.

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